Το σύνολο των πιστωτικών μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Διπλώματος Μεταπτυχιακών Σπουδών είναι ενενήντα (90). Το αναλυτικό πρόγραμμα μαθημάτων ανά εξάμηνο διαμορφώνεται ως εξής:

Α' εξάμηνο

• Εμβρυολογία, ανατομία και φυσιολογία του θυρεοειδούς αδένα- εκτίμηση θυρεοειδικής λειτουργίας. (2 ECTS)
• Παθήσεις θυρεοειδούς i. Θυρεοειδίτιδες ii. Υποθυρεοειδισμός iii. Υπερθυρεοειδισμός iv. Αυτοάνοσες παθήσεις v. Θυρεοειδικές επείγουσες καταστάσεις (2 ECTS)
• Θυρεοειδοπάθειες σε ιδιαίτερες καταστάσεις (παιδική ηλικία, κύηση-γαλουχία-ηλικιωμένοι) (2 ECTS)
• Εκτίμηση θυρεοειδικών όζων και βρογχοκήλης. Κακοήθη νεοπλάσματα θυρεοειδούς (2 ECTS)
• Χειρουργική ανατομία θυρεοειδούς και τραχήλου. (4 ECTS)
• Ανοιχτή θυρεοειδεκτομή και ιδιαίτερα ζητήματα. (καταδυόμενη βρογχοκήλη, επανεπέμβαση, κακοήθεια) (4 ECTS)
• Ελάχιστα επεμβατική θυρεοειδεκτομή (2 ECTS)
• Πηγές ενέργειας στη χειρουργική των ενδοκρινών αδένων (2 ECTS) 
• Νευροπαρακολούθηση (2 ECTS)
• Διεγχειρητικές επιπλοκές: Οι κλασικές (κάκωση παλίνδρομου, άνω λαρυγγικού, παραθυρεοειδών, κοσμητικές) (2 ECTS)
• Διεγχειρητικές επιπλοκές: Oι σπάνιες (κακώσεις τραχείας, μεγάλων αγγείων, νεύρων σε πλάγιο λεμφαδενικό καθαρισμό, πνευμοθώρακας) (2 ECTS)
• Μετεγχειρητικές επιπλοκές (παλίνδρομου λαρυγγικού νεύρου, κακώσεις παραθυρεοειδών, σύνδρομο Horner, επιπλοκές λόγω θέσης, επιπλοκές μετα στερνοτομή) (2 ECTS)
• Επιπλοκές των ελάχιστα επεμβατικών τεχνικών. (2 ECTS)

ΣΥΝΟΛΟ 30 ECTS

Β' εξάμηνο

• Ιατρογενής υποθυρεοειδισμός, μεταβολικές επιδράσεις της θεραπείας υποκατάστασης με θυροξίνη. Ποιότητα ζωής μετά από θυρεοειδεκτομή (2 ECTS)
• Ανατομία, εμβρυολογία, φυσιολογία παραθυρεοειδών αδένων (2 ECTS)
• Παθήσεις παραθυρεοειδών (2 ECTS)
• Απεικονιστικός έλεγχος (imaging) παραθυρεοειδών (2 ECTS)
• Παραθυρεοειδεκτομή-διερεύνηση τραχήλου- διεγχειρητική μέτρηση PTH. (2 ECTS)
• Ελάχιστα επεμβατική παραθυρεοειδεκτομή (2 ECTS)
• Radio-guided παραθυρεοειδεκτομή (2 ECTS)
• Επιπλοκές χειρουργικής παραθυρεοειδών (2 ECTS)
• Το μέλλον της χειρουργικής θυρεοειδών και παραθυρεοειδών (2 ECTS) 
• 10η έως 13η εβδομαδα: παρακολούθηση κατά ομάδες στην χειρουργική αίθουσα 12 (4 εβδομάδες Χ3 ECTS/εβδομάδα)

ΣΥΝΟΛΟ 30 ECTS

Γ' εξάμηνο

• Εκπόνηση Mεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (30 ECTS)

Όλα τα μαθήματα του προγράμματος διδάσκονται κυρίως στην ελληνική γλώσσα, αλλά και στην αγγλική κατά περίπτωση.