Το Π.Μ.Σ. διαρθρώνεται σε τέσσερα (4) εξάμηνα διάρκειας δεκατριών (13) εβδομάδων έκαστο.

• Στο πρώτο (Α’ ) εξάμηνο διδάσκονται έξι (6) υποχρεωτικά μαθήματα με πέντε (5) πιστωτικές μονάδες (ECTS) ανά μάθημα.
• Στο δεύτερο (Β’ ) εξάμηνο διδάσκονται έξι (6) υποχρεωτικά μαθήματα με πέντε (5) ECTS ανά μάθημα.
• Στο τρίτο (Γ’ ) εξάμηνο διδάσκονται πέντε (5) υποχρεωτικά μαθήματα εκ των οποίων τα τέσσερα (4) μαθήματα είναι με πέντε (5) ECTS και το ένα (1) μάθημα είναι με δέκα (10) ECTS.
• Στο τέταρτο (Δ’ ) εξάμηνο εκπονείται η Μ.Δ.Ε. [τριάντα (30) ECTS].

Το Π.Μ.Σ. ακολουθεί το μεικτό σύστημα εκπαίδευσης (blended learning), το οποίο συνδυάζει τη διά ζώσης εκπαιδευτική διαδικασία με την εξ αποστάσεως εκπαίδευση. Τα μαθήματα πραγματοποιούνται διά φυσικής παρουσίας σε ποσοστό είκοσι τοις εκατό (20%) του συνόλου των διδακτικών ωρών και με τη χρήση μεθόδων σύγχρονης εξ αποστάσεως διδασκαλίας σε ποσοστό ογδόντα τοις εκατό (80%) του συνόλου των διδακτικών ωρών.

Όλα τα μαθήματα του προγράμματος διδάσκονται στην ελληνική γλώσσα και η γλώσσα εκπόνησης της Μ.Δ.Ε. είναι επίσης η ελληνική.

Α’ Εξάμηνο φοίτησης (6 υποχρεωτικά μαθήματα) (30 ECTS)

1. Εισαγωγή στο Σύστημα Ενδοκρινών Αδένων (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
2. Φυσιολογία – Ανατομία (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
3. Καλοήθεις Παθήσεις Θυρεοειδούς (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
4. Κακοήθεις Παθήσεις Θυρεοειδούς (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
5. Χειρουργική Αντιμετώπιση του Θυρεοειδούς Αδένα (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
6. Εναλλακτικές Θεραπείες στις παθήσεις του Θυρεοειδούς (5 ECTS – Υποχρεωτικό)

Β’ Εξάμηνο φοίτησης (6 υποχρεωτικά μαθήματα) (30 ECTS)

1. Παθήσεις Παραθυρεοειδών Aδένων (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
2. Χειρουργική Αντιμετώπιση Παθήσεων Παραθυρεοειδών Αδένων (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
3. Καλοήθεις Παθήσεις Επινεφριδίων (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
4. Κακοήθεις Παθήσεις Επινεφριδίων (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
5. Χειρουργική Αντιμετώπιση Παθήσεων Επινεφριδίων (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
6. Πολλαπλά Ενδοκρινικά Σύνδρομα (5 ECTS – Υποχρεωτικό)

Γ’ Εξάμηνο φοίτησης (5 υποχρεωτικά μαθήματα) (30 ECTS)

1. Νευροενδοκρινικοί Όγκοι-Παθοφυσιολογία (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
2. Νευροενδοκρινικοί όγκοι Παγκρέατος (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
3. Νευροενδοκρινικοί όγκοι Πεπτικού (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
4. Χειρουργική Αντιμετώπιση των Νευροενδοκρινικών Όγκων (5 ECTS – Υποχρεωτικό)
5. Συμπληρωματική θεραπεία Νευροενδοκρινικών Όγκων (10 ECTS – Υποχρεωτικό)

Δ’ Εξάμηνο φοίτησης (Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία) (30 ECTS)