Η διάρθρωση του προγράμματος είναι η ακόλουθη:

1ο Εξάμηνο

Θεματική Ενότητα: Μαθηματική Μοντελοποίηση στη Βιολογία (Υ, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα:

• Μεθοδολογίες μοντελοποίησης
• Μοντέλα Αναπαράστασης Βιολογικών Μηχανισμών

Θεματική Ενότητα: Νευροβιολογία και Μοντελοποίηση Κυτταρικών Συστημάτων (Υ, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα:

• Νευροβιολογία
• Κυτταρικά Συστήματα

Θεματική Ενότητα: Καταγραφή και Επεξεργασία Νευρικών Βιοσημάτων (Ε, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα:

• Προσδιορισμός και μελέτη βιοσημάτων
• Εντοπισμός και επεξεργασία νευρικών βιοσημάτων

Θεματική Ενότητα: Μηχανική Νευρικής Αποκατάστασης (Ε, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα:

• Νευροανατομία
• Νευρική Αποκατάσταση

2ο Εξάμηνο

Θεματική Ενότητα: Αλγόριθμοι στη Μοριακή Βιολογία και στη Δομική Βιοπληροφορική (Υ, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα:

• Αλγόριθμοι Μοριακής Βιολογίας
• Αλγόριθμοι Βιοπληροφορικής

Θεματική Ενότητα: Σχεδιασμός Βάσεων Βιολογικών Δεδομένων και Γλώσσες Προγραμματισμού (Υ, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα:

• Σχεδιασμός Βάσεων Δεδομένων
• Γλώσσες Προγραμματισμού για βιολογικά δεδομένα

Θεματική Ενότητα: Bιoιατρική Τεχνολογία και Συστήματα Ιατρικής Απεικόνισης (Ε, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα:

• Συστήματα Ιατρικής απεικόνισης
• Ανάλυση και Επεξεργασία ιατρικών Εικόνων

Θεματική Ενότητα: Πρωτεομική, Γενωμική και Γονιδιωματική (Ε, 10 ECTS) με γνωστικά Αντικείμενα: 

• Πρωτεομική
• Γενωμική
• Γονιδιωματική

Εκπόνηση Διπλωματικής Εργασίας (30 ECTS)

Η εκπόνηση της Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας προϋποθέτει την επιτυχή ολοκλήρωση έξι (6) Θεματικών Ενοτήτων από τις οκτώ (8). Η Διπλωματική Εργασία θα είναι βιβλιογραφικού ή ερευνητικού χαρακτήρα και το πλαίσιο εκπόνησης και βαθμολόγησής της θα προσδιορίζεται από τον κανονισμό Σπουδών του «κοινού ΜΠΣ».

Η γλώσσα διδασκαλίας του Δ.Π.Μ.Σ είναι η ελληνική. Η γλώσσα εκπόνησης διπλωματικής εργασίας είναι η ελληνική είτε η αγγλική.