Το πρόγραμμα των μαθημάτων ανά ειδίκευση διαμορφώνεται ενδεικτικά ως εξής:

1. Ειδίκευση: Βυζαντινή Ιστορία

Α' Εξάμηνο 

• Θέματα εμβάθυνσης στην ιστορία του βυζαντινού κόσμου (15 ECTS)
• Πηγές για τη βυζαντινή ιστορία ή βυζαντινή φιλολογία ή αρχαιολογία (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Β' Εξάμηνο 

• Διεπιστημονικό Σεμινάριο (15 ECTS)
• Βυζαντινή κοινωνία και οικονομία ή Πολίτευμα και διοίκηση (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γ' Εξάμηνο 

• Θέματα εμβάθυνσης στην ιστορία του βυζαντινού κόσμου (15 ECTS)
• Διεθνείς σχέσεις και διπλωματία (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Δ' Εξάμηνο 

• Εκπόνηση μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γενικό Σύνολο 120 ECTS 

2. Ειδίκευση: Βυζαντινή Αρχαιολογία και Τέχνη

Α' Εξάμηνο 

• Θέματα εμβάθυνσης στη Βυζαντινή Αρχαιολογία ή Θέματα εμβάθυνσης στη Βυζαντινή Τέχνη (15 ECTS)
• Μεθοδολογικά ζητήματα της μελέτης της Βυζαντινής Αρχαιολογίας και Τέχνης ή Ελεύθερη σεμιναριακή εργασία ή Πρακτική στο πεδίο, σε μουσείο ή ερευνητικό κέντρο (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Β' Εξάμηνο 

• Διεπιστημονικό Σεμινάριο (15 ECTS)
• Υλικός πολιτισμός του Βυζαντίου ή Ελεύθερη σεμιναριακή εργασία ή Πρακτική στο πεδίο, σε μουσείο ή ερευνητικό κέντρο (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γ' Εξάμηνο 

• Θέματα εμβάθυνσης στη Βυζαντινή Αρχαιολογία ή Θέματα εμβάθυνσης στη Βυζαντινή Τέχνη (15 ECTS)
• Μεθοδολογικά ζητήματα της μελέτης της Βυζαντινής αρχαιολογίας και τέχνης (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Δ' Εξάμηνο 

• Εκπόνηση μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γενικό Σύνολο 120 ECTS