Το πρόγραμμα χαρακτηρίζεται εντατικό 80 πιστωτικών μονάδων (ECTS), οι οποίες προκύπτουν από την παρακολούθηση και την επιτυχή εξέταση των μαθημάτων, εργαστηρίων, σεμιναρίων στα 2 εξάμηνα (65 πιστωτικές μονάδες, ECTS) και την εκπόνηση μεταπτυχιακής διατριβής (15 πιστωτικές μονάδες, ECTS) κατά τη θερινή περίοδο. Η εκπαίδευση παρέχεται από ειδικούς που προέρχονται από τον ακαδημαϊκό χώρο, από ερευνητικά κέντρα, της ημεδαπής και αλλοδαπής, από τον χώρο της βιομηχανίας της βιοτεχνολογίας και από άλλους εθνικούς και διεθνείς φορείς. Η επιλογή των ανωτέρω θα γίνει σύμφωνα με τις διατάξεις του ν. 4485/2017. Πέραν τούτων ο μεταπτυχιακός φοιτητής υποχρεούται σε δίμηνη πρακτική (εργαστηριακή) άσκηση σε σε εθνικά και διεθνή ιδρύματα ή φορείς φορείς που έχουν σχέση με την παρεχόμενη εκπαίδευση του ΠΜΣ.

Το σύνολο των Πιστωτικών Μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Μ.Δ.Ε. ανέρχονται σε ογδόντα (80).

Τα μαθήματα, η διδακτική και ερευνητική απασχόληση και οι κάθε άλλου είδους εκπαιδευτικές και ερευνητικές δραστηριότητες για την απονομή του ΜΔΕ ορίζονται ως εξής:

Α' Εξάμηνο 

• Εισαγωγή σε Βιολογία (2 ECTS)
• Εισαγωγή στην Πληροφορική (2 ECTS)
• Βιοπληροφορική (4 ECTS)
• Ομικές τεχνολογίες και ψηφιοποίηση εικόνας (4 ECTS) 
• Βιολογία συστημάτων (5 ECTS) 
• Βιολογικά δίκτυα και ανάλυση μεγάλου όγκου δεδομένων (4 ECTS) 
• Βιολογία οργανισμών μοντέλων (4 ECTS) 
• Εργαστηριακή εισαγωγή και έρευνα (10 ECTS)

Σύνολο 35 ECTS 

Β' Εξάμηνο 

• Δικτύωση ενζύμων και νανοτεχολογία (3 ECTS)
• Σηματοδοτικά μονοπάτια και αναπτυξιακή δικτύωση (3 ECTS) 
• Μαθηματική μοντελοποίηση (προτυποποίηση) (4 ECTS)
• Ανάπτυξη ικανοτήτων-μεθοδολογία της έρευνας (5 ECTS) 
• Ανάπτυξη εργαστηριακής εμπειρίας (10 ECTS) 
• Σεμινάρια (2 ECTS)

Και ένα από τα παρακάτω: 

• Συνθετική Βιολογία (3 ECTS)
• Βιοφυσική και στατιστική μοντελοποίηση (προτυποποίηση) (3 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Θερινή περίοδος

• Εκπόνηση μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας

Σύνολο 30 ECTS 

Με αποφάσεις των αρμόδιων οργάνων μπορεί να γίνει ανακατανομή και τροποποίηση των μαθημάτων και θα περιλαμβάνεται στον Κανονισμό Μεταπτυχιακών Σπουδών