Το σύνολο των Πιστωτικών Μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του ΔΜΣ ανέρχεται σε ενενήντα (90). Τα μαθήματα του ΠΜΣ είναι εξαμηνιαία. Η διδασκαλία θα γίνεται στην Ελληνική και/ή στην Αγγλική γλώσσα. Για τη λήψη του ΔΜΣ οι φοιτητές υποχρεούνται να παρακολουθήσουν και να εξεταστούν επιτυχώς: σε όλα τα υποχρεωτικά μαθήματα κατά τα δυο εξάμηνα (Α΄ και Β΄ εξάμηνα για την ειδίκευση «Θεωρητική, Υπολογιστική Φυσική και Αστροφυσική»), καθώς και στα μαθήματα επιλογής που προβλέπονται κατά περίπτωση σε κάθε εξάμηνο προκειμένου να συμπληρωθεί ο απαραίτητος αριθμός πιστωτικών μονάδων, και να εκπονήσουν επιτυχώς διπλωματική εργασία στο Β΄ και Γ΄ εξάμηνο.

1. Ειδίκευση: «Θεωρητική, Υπολογιστική Φυσική και Αστροφυσική»

Α' Εξάμηνο 

• Κβαντομηχανική Ι (9 ECTS)
• Ηλεκτροδυναμική (7 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης εφόσον επιλεγεί στο Β΄ εξάμηνο η “Στατιστική Φυσική”, ειδάλλως επιλέγεται υποχρεωτικά η “Μηχανική” (7 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης (7 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

B' Εξάμηνο 

• Μαθηματικές Μέθοδοι Φυσικής (7 ECTS)
• Παρουσίαση Βιβλιογραφίας (2 ECTS)
• Ερευνητική Μεθοδολογία (Έναρξη Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (14 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης εφόσον επιλεγεί στο Α’ εξάμηνο η “Μηχανική”, ειδάλλως επιλέγεται υποχρεωτικά η “Στατιστική Φυσική” (7 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γ' Εξάμηνο 

• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης (7 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης (7 ECTS)
• Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία (16 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

ΜΑΘΗΜΑΤΑ ΕΠΙΛΟΓΗΣ (σε παρένθεση το εξάμηνο διδασκαλίας)

• Μηχανική (Α’) 
• Κβαντομηχανική ΙΙ (A’ ή Γ’)
• Κβαντική Θεωρία Πεδίου (Α’ ή Γ’)
• Θεωρία Ομάδων και Εφαρμογές στην Φυσική (Α’ ή Γ’)
• Γενική Θεωρία Σχετικότητας (A’ ή Γ’)
• Στοιχειώδη Σωμάτια και Αστροσωματιδιακή Φυσική (Β’)
• Στατιστική Φυσική (Β’)
• Τεχνικές Προσομοίωσης Φυσικών Συστημάτων (Β’)
• Θεωρία και Εφαρμογές της Κβαντικής Πληροφορίας (Β’)
• Υπολογιστική Αστροφυσική (Β’)
• Ειδικά Θέματα Κοσμολογίας (Α’ ή Γ’)
• Ειδικά Θέματα Παρατηρησιακής Αστροφυσικής (Α’ ή Γ)
• Ειδικά Θέματα Θεωρητικής Αστροφυσικής  (Α’ ή Γ’)
• Φυσική Αστέρων (Β’)
• Στοχαστικά Μαθηματικά και Εφαρμογές (Γ΄)
• Ειδικά Θέματα Μηχανικής των Ρευστών (Α΄ ή Γ΄)

2. Ειδίκευση: «Φυσική και Τεχνολογία Υλικών - Φωτονική»

Α' Εξάμηνο 

• Κβαντική Φυσική (10 ECTS)
• Ηλεκτρομαγνητισμός (10 ECTS)
• Τεχνικές Χαρακτηρισμού Υλικών (10 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Β' Εξάμηνο 

• Έναρξη Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (9 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης (7 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης (7 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης (7 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γ' Εξάμηνο 

• Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία (23 ECTS)
• Επιλογή από τον κατάλογο μαθημάτων επιλογής της ειδίκευσης (7 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

ΜΑΘΗΜΑΤΑ ΕΠΙΛΟΓΗΣ (σε παρένθεση το εξάμηνο διδασκαλίας)

• Φυσική και Τεχνολογία Υλικών και Διατάξεων Στερεάς Κατάστασης (Β)
• Υλικά και Διατάξεις για Ενεργειακές Εφαρμογές (Β)
• Φασματοσκοπίες Λέιζερ (Β)
• Κβαντική Οπτική (Β)
• Μαθηματικές Μέθοδοι Φυσικής (Β)
• Φυσική και Τεχνολογία Υλικών και Διατάξεων Μαλακής Συμπυκνωμένης Ύλης (Γ)
• Ειδικά θέματα Οπτικής (Γ)